blast

• blast bir moleküler biyoloğun en büyük dostudur. basic local alignment search tool ismi pek bir ipucu vermese de elinizdeki dna, rna ve protein serilerini genom haritası bilinen organizmaların genom, transkriptom ve proteomlarıyla karşılaştırıp bu serinin hani gende hangi benzerlikle bulunduğunu baz baz, aminoasit aminoasit kontrol edip, çıkarır verir size. primer tasarlarken, çeşitli transkripsiyon faktörleriyle iş yaparken, genomun neresindeyim? diye kara kara düşünürken blast yardıma koşar.
  herhangi bir araştırmanın besmelesi elinizdeki kodu blastlamak olup blastlamadan iş yapanı evrim çarpar.
  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/
  
  bir de ucscnin güzel biyoenformatikerlerinin kodladığı daha az işlevsel blat yani blast-like alignment search tool vardır ki daha yeni olduğu ve daha cici göründüğü için insan genomu üzerinde çalışanlar bunu kullanır.
  http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgblat