3'oh

• dna polimerazın aktivite gösterebilmesi için kesin suretle ihtiyaç duyduğu, deoksiriboz şekerinin 3. karbonuna bağlı ucu ifade eder. rna polimerazdan farklı olarak dna polimeraz 3'oh ucuna ihtiyaç duyar ^*. bunun için primaz enzimi dna'nın tekli zincirine komplementer küçük bir rna primeri oluşturur (primer template junction). bu rna primeri dna polimeraz tarafından tanınır ve serbest 3'oh sayesinde de uygun dntp'leri eklemeye başlar. eee bir soru: “sen deoksiriboz dedin ama rna primerinden bahsediyorsun, yani ribozun 3. karbonuna dntp nasıl eklenecek?” çünkü ribozun 3. karbonunda da serbest oh ucu bulunur. ^* evet; “primaz, rna primerini oluşturur.” diyoruz ama daha doğru tanım: “primaz, dna polimeraz bağımlı rna primerini sentezleyen enzimdir.” sonrasında bu 3' oh ucuna uygun dntp (deoxynucleoside triphosphate) eklenir ve ortamdan 2 fosfat grubu ya da diğer bir deyişle yapışık beta-fosfat ve gama-fosfat (pyrophosphate) uzaklaşır. bu uzaklaşmanın sisteme yüklediği enerji yeterince fazladır ki bu da dna pol.ın bir sonraki dntp'yi eklemesine olanak sağlar.
  
  not1: rna polimeraz primersiz rna sentezi yapabilir.
  
  not2: rna primerleri rna h enzimi tarafından ortamdan uzaklaştırılır ve boşluk dna pol. tartından tekrar doldurulur ama yine de son 2 nükleotit arsında boşluk (nick) kalır. bu nick, dna ligaz ile kapatılır. dna ligaz, iki nükleotit arasındaki fosfodiester bağını kurar. ^*
  
  edit: molecular biology of the gene kitabına biraz göz attım ve ufak düzeltmeler yaptım.